En teoria pots fer-ho tractant els fitxers .exe com si fossin programes normals (fent doble clic en un fitxer .exe, aquest s'hauria d'executar com si fossis en Windows).
De tota manera, wine no és Windows i alguns programes delicats (l'Office crec que n'és un exemple), segurament no acabaran de funcionar bé. El que pots fer en aquests casos, i mentre intentes migrar definitivament a Linux i a paquets ofimàtics lliures, és instal·lar-te programes com el Virtualbox (captures) que et permeten tenir un Windows instal·lat en una finestra de l'Ubuntu. El rendiment d'aquest Windows "virtual" és inferior al d'un Windows real, però té les mateixes funcionalitats que el Windows real i, evidentment, hi pots instal·lar els mateixos programes.
Crec que el paquet per Ubuntu que cal instal·lar és «virtualbox-ose»